教案頻發的原因主要有以下幾個:

　　治外法權凌駕中國法律

　　19世紀末，西方傳教士被準許在中國傳教和成立教會。在治外法權之下，不單教會的西方神職人員不受清政府管轄，一般中國信徒也常獲教會庇護。地方上，基督教教會每每因為文化、風俗差異等等各種原因，與地方民眾發生沖突。部分不良教民欺壓當地民眾，而地方政府卻往往因為懼于教會的治外法權，不欲與洋人作對而未能持公處理，造成教案。

　　仇外心態

　　清末華北地方經濟破產，傳統社會綱紀解體；在轉變的時代，人心惶惶，各式秘密會社紛起。總之，教會、教眾和洋人、洋貨，成為了仇視的對象。

　　謠言

　　當時社會有許多詆毀西方人的謠言，如說洋人醫院挖小孩眼睛制迷藥、神父用特制器具吸男童陽精等等，而一般中國百姓一向迷信這類傳言，從而人人自危，對西方人及中國教友恨之入骨。

　　守舊勢力煽動

　　教會除了傳教之外也興醫辦學、提倡破除陋習（如纏足納妾）、傳播新思想（如憲政、民主），與維新運動一樣不可避免會引起守舊勢力的仇恨。

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